Google DeepMind, Meta i Biohub zbudują otwartą bazę danych do symulacji ludzkich komórek

Instytut Biohub, amerykański Departament Energii oraz Narodowe Instytuty Zdrowia formalnie podpisali porozumienie dotyczące rozwoju cyfrowych modeli biologicznych. Wraz z partnerami prywatnymi przeznaczą niemal 2 mld dolarów na utworzenie otwartej bazy ustandaryzowanych informacji, pomiary laboratoryjne oraz moc obliczeniową. Celem przedsięwzięcia jest opracowanie wirtualnej komórki, która umożliwi cyfrowe symulowanie reakcji biologicznych i znaczne przyspieszenie prac nad nowymi lekami.

Sektor publiczny oraz liderzy rynku technologicznego

Amerykańskie agencje rządowe oraz prywatne przedsiębiorstwa ogłosiły globalny program nakierowany na pozyskiwanie i udostępnianie danych biologicznych przystosowanych do szkolenia AI. Łączny budżet projektu wynosi 1,8 mld dolarów, co czyni go największym skoordynowanym zobowiązaniem finansowym w tej dziedzinie. W ramach porozumienia instytucja Biohub, Departament Energii USA oraz Narodowe Instytuty Zdrowia opracują otwarty zasób badawczy, który posłuży do analizy i leczenia chorób. Do przedsięwzięcia dołączyły również koncerny Google DeepMind, Isomorphic Labs oraz Meta, inwestując łącznie 300 mln dolarów. Jak podkreśla Alex Rives, szef pionu naukowego w Biohub, dokładny model predykcyjny biologii mógłby znacząco przyspieszyć odkrycia naukowe, pozwalając badaczom na prowadzenie eksperymentów w środowisku cyfrowym. Powstanie wirtualnej komórki stanowi fundamentalny krok dla kolejnej ery nauki, wymagający szerokiej koordynacji na poziomie międzynarodowym.

Superkomputery exascale oraz zautomatyzowane laboratoria

Wkład Departamentu Energii wyniesie ponad 500 mln dolarów w ciągu pięciu lat i obejmie badania komórkowe, analitykę oraz obliczenia realizowane w państwowych laboratoriach. Amerykański resort wykorzysta superkomputery exascale, autonomiczne platformy badawcze oraz wyspecjalizowane ośrodki, w tym Joint Genome Institute i Environmental Molecular Sciences Laboratory. Z kolei Narodowe Instytuty Zdrowia wniosą zasoby zgromadzone w ramach wcześniejszych projektów federalnych o wartości ponad 500 mln dolarów. Instytut Biohub ze swojej strony wnosi 500 mln dolarów na rozwój zaawansowanych technik pomiarowych, takich jak tomografia krio-elektronowa czy mikroskopia tkankowa. Darío Gil, podsekretarz stanu ds. nauki w DOE, wskazuje, że połączenie zaplecza obliczeniowego i eksperymentalnego laboratoriów państwowych z modelami Biohub wyznacza nowy standard otwartej nauki, który przyspieszy odkrycia w medycynie i biotechnologii.

Zaplecze dla  nauki

W realizację programu zaangażowały się uznane instytucje badawcze, w tym Allen Institute, Broad Institute, Gladstone Institutes, Human Cell Atlas, Human Protein Atlas oraz Wellcome Sanger Institute. Wsparcie w obszarze wysokowydajnej infrastruktury obliczeniowej, oprogramowania dziedzinowego oraz wiedzy inżynieryjnej zapewnia firma NVIDIA, natomiast organizacja Renaissance Philanthropy wspiera pozyskiwanie dodatkowych środków na gromadzenie materiałów. Partnerzy zamierzają zbudować warstwę technologiczną zapewniającą spójność danych poprzez jednolite standardy, identyfikatory oraz pojedynczy punkt dostępu. Pushmeet Kohli, wiceprezes ds. AI dla nauki w Google DeepMind, zauważa, że nowa inwestycja pomoże zbudować ustandaryzowaną przestrzeń danych, zapewniającą naukowcom z całego świata podstawę do sprawniejszego modelowania procesów biologicznych